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本品的性質與它的聚電解質和聚糖的性質有關。大量氨基的存在允許殼聚糖與陰離子系統發生化學反應，因此這兩種物質合用會引起理化性質的改變。殼聚糖作為溶液被存放和使用時，需處于酸性環境中，但由于縮醛結構的存在，使其在酸性溶液中發生降解，溶液黏度隨之下降。如果加入乙醇、甲醇、丙酮等可延緩殼聚糖溶液黏度降低，以乙醇作用最明顯。

本品又名脫乙酰甲殼質、可溶性甲殼素、聚氨基葡萄糖，為類白色粉末，無臭，無味。本品微溶于水，幾乎不溶于乙醇。本品是一種陽離子聚胺，在pH< 6.5時電荷密度高（因此可吸附于陰離子表面并可與金屬離子螯合）。本品是一種帶有活潑羥基與氨基的線型聚電解質（可進行化學反應和成鹽）。

純凈的殼聚糖為白色或灰白色半透明的片狀固體，溶于稀酸呈黏稠狀，在稀酸中殼聚糖的β -1，4-糖苷鍵會慢慢水解，生成低相對分子質量的殼聚糖。溶于酸性溶液形成帶正電的陽離子基團。殼聚糖在溶液中是帶正電荷的多聚電解質，具有很強的吸附性。殼聚糖分子中含有氨基，具有堿性，在的條件下可生成銨鹽，可以使腸內pH值轉為堿性，改善酸性體質。甲殼素對人體細胞有很強的親和性，進入人體內的甲殼素被分解成基本單位。人體內存在的葡萄糖胺。而乙酰葡萄糖胺是體內透明質酸的基本組成單位。因此甲殼素和殼聚糖對人體細胞有很好的親和性，不會產生排斥反應。